«Человеко-машинный интерфейс» – продолжение истории Мотоко Кусанаги, главной героини манги «Отряд особого назначения» («Призрак в доспехах»), которое вышло отдельной книгой в 1991 году. События здесь разворачиваются спустя примерно четыре года и пять месяцев после того, как Мотоко совершила слияние с самопровозглашенной искусственной формой жизни и ушла из Девятого отдела Службы общественной безопасности.