Чашка широко используется в микробиологии для культивирования колоний микроорганизмов. Для этого её заполняют слоем питательной среды, на который производят посев культуры микроорганизмов. Кроме того, чашка Петри зачастую используется в прикладных целях, например, для испарения жидкостей, хранения мелких фрагментов различных препаратов, препарирования небольших животных и растений, травления печатных плат небольших размеров. Изделие соответствует Перечню средств обучения и воспитания, утвержденному Приказом Минобрнауки России N 465 (подраздел «Профильный медико-биологический класс»).